问题：分公司设立在上海为独立核算，汇算清缴时可以按照总公司15%的高新技术企业的税率核算吗？
答：《财政部、国家税务总局关于高新技术企业境外所得适用税率及税收抵免问题的通知》（财税[2011]47号）第一条规定，以境内、境外全部生产经营活动有关的研究开发费用总额、总收入、销售收入总额、高新技术产品（服务）。
收入等指标申请并经认定的高新技术企业，其来源于境外的所得可以享受高新技术企业所得税优惠政策，即对其来源于境外所得可以按照15%的优惠税率缴纳企业所得税，在计算境外抵免限额时，可按照15%的优惠税率计算境内外应纳税总额。
据此，独立核算的分公司研究开发费用总额、总收入、销售收入总额、高新技术产品（服务）收入等指标未计入申请并经认定的高新技术企业，不享受高新技术企业15%优惠税率。
