问题：1.自产的库存商品报废（一种是生产过程中质量不合格报废，一种是滞销过期报废），增值税与所得税有什么相关规定？

2.进项税如果要转出，是不是要将库存商品还原成耗用多少原材料，再根据原材料做进项转出？
3.如果说，还原的原材料税率比较多，有些是普票供应商，有些是专票，即是企业无法准确区分时，这个进项转出的税率怎么确定呢？

答：增值税。《营业税改征增值税试点实施办法》（财税〔2016〕36号）规定，
第二十七条下列项目的进项税额不得从销项税额中抵扣：
（三）非正常损失的在产品、产成品所耗用的购进货物（不包括固定资产）、加工修理修配劳务和交通运输服务。

第二十八条三款非正常损失，是指因管理不善造成货物被盗、丢失、霉烂变质，以及因违反法律法规造成货物或者不动产被依法没收、销毁、拆除的情形。

一般纳税人自产的库存商品，因质量不合格和滞销过期报废，不属于因管理不善造成货物霉烂变质的非正常损失，无需进项税转出。

企业所得税。《企业资产损失所得税税前扣除管理办法》（国家税务总局公告2011年第25号）第二十七条规定，存货报废、毁损或变质损失，为其计税成本扣除残值及责任人赔偿后的余额，应依据以下证据材料确认：
（一）存货计税成本的确定依据；
（二）企业内部关于存货报废、毁损、变质、残值情况说明及核销资料；
（三）涉及责任人赔偿的，应当有赔偿情况说明；
（四）该项损失数额较大的（指占企业该类资产计税成本10%以上，或减少当年应纳税所得、增加亏损10%以上，下同），应有专业技术鉴定意见或法定资质中介机构出具的专项报告等。

据此，企业存货报废、毁损或变质损失，应以专项申报的方式向税务机关申报税前扣除。