问题：自然人的综合所得和生产经营所得是可以分别扣除6万，还是只能选择一个所得扣除？

答：《个人所得税法（2018年修正）》第六条规定，应纳税所得额的计算：
（一）居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。

（三）经营所得，以每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后的余额，为应纳税所得额。
《个体工商户个人所得税计税办法》（国家税务总局令第35号）第二十一条规定，个体工商户实际支付给从业人员的、合理的工资薪金支出，准予扣除。

个体工商户业主的费用扣除标准，依照相关法律、法规和政策规定执行。

个体工商户业主的工资薪金支出不得税前扣除。

依据上述规定，居民个人取得综合所得和经营所得，综合所得以每一纳税年度的收入额减除费用六万元，不存在经营所得重复减除六万元。